Johnston progresó en la cantera del Celtic y tuvo cesiones en el Vitoria de Guimaraes y el West Brom antes de un traspaso permanente a la región de Black Country en 2024 por 3 millones de libras. El verano pasado, Johnston estuvo cerca de unirse al club brasileño Flamengo por una cantidad de alrededor de 5 millones de libras, pero el traspaso no se concretó debido a la reacción negativa de los aficionados en Río de Janeiro.

Globo.com informó que un director llegó a un acuerdo a mediados del año pasado para fichar al irlandés Mikey Johnston del West Bromwich, que juega en la segunda división inglesa, pero el presidente de Flamengo, Bap, canceló el acuerdo.

En 2025, un acuerdo de transferencia para que el extremo irlandés de 26 años Michael Johnston se uniera al Flamengo estuvo casi completado, con planes de viaje establecidos para Río de Janeiro. Sin embargo, la transferencia finalmente no se concretó. Surgieron preocupaciones en el departamento médico del Flamengo sobre el historial de cirugías y lesiones de Johnston, lo que generó un debate interno significativo sobre el posible fichaje. Según un informe de ESPN, el equipo médico del Flamengo emitió una advertencia de 'luz amarilla', lo que detuvo el acuerdo debido a preocupaciones sobre la capacidad de Johnston para mantener un rendimiento constante dado su historial de lesiones. A pesar de este revés, Johnston ha estado rindiendo fuertemente en el West Bromwich en el Championship. Su contrato con el club es válido hasta el 30 de junio de 2028, y Transfermarkt estima su valor de mercado en 3,00 millones de euros.