Hoffenheim mostró interés en Dejan Ljubičić, pero él optó por unirse al Dinamo Zagreb. A pesar de recibir ofertas más lucrativas de cinco clubes alemanes, incluida una revisión médica preparada por el Union Berlin y un fuerte esfuerzo por retenerlo por su club actual, el Köln, Ljubičić tomó la decisión de unirse al Dinamo Zagreb. El factor decisivo fue una llamada de Zvonimir Boban, cuya visión para el club y la afinidad personal de Ljubičić por el Dinamo superaron los incentivos financieros ofrecidos por otros clubes. El movimiento de Ljubičić al Dinamo no fue motivado por consideraciones financieras, sino por su deseo de larga data de jugar para el club croata, al cual consideraba su número uno en sentido de aficionado. Su transferencia fue recibida con comprensión por parte del Köln, que reconoció sus contribuciones al club y le ofreció un nuevo contrato, pero su corazón estaba puesto en Zagreb.