João Marcelo je trebao preći u Internacional kao dio pregovora koji bi doveli Vitãoa u Cruzeiro. Međutim, trener Cruzeira, Tite, razgovarao je s 25-godišnjim brazilskim središnjim braničem i izrazio da računa na njega za početak sezone. João Marcelo se pridružio Cruzeiru u srpnju 2024., a njegov ugovor vrijedi do kraja 2028. godine. Odigrao je jednu utakmicu u Campeonato Mineiro u sezoni 2025/2026. Prema Transfermarktu, njegova trenutna tržišna vrijednost iznosi 4,50 milijuna eura.